Федеральная налоговая служба Российской Федерации в письме № ЕД-4-3/22125@, датированном 25 декабря 2012 года, приводит пояснения касательно порядка применения понижательных коэффициентов по налогу на прибыль для налогоплательщиков Москвы и Подмосковья. Данные понижательные ставки утверждены законами этих регионов для отдельных категорий налоговых агентов.
Законом Московской области N 151/2004-ОЗ от 24 ноября 2004 года установлены правила снижения ставки налога на прибыль предприятия для таких налогоплательщиков, как организации, которые в качестве наемных работников привлекают инвалидов, или которые помогают некоммерческим организациям, государственным, бюджетным и муниципальным учреждениям, товариществам собственников жилья, протезно-ортопедическим организациям или организациям народных художественных промыслов. Также Законами города Москвы N 39 от 10 октября 2007 года и N 12 от 5 марта 2003 года предполагается снижение ставки налога на прибыль для производителей легковых автомобилей, организаций, использующих труд инвалидов, организаций, уставной капитал которых сформирован за счет вкладов общественных организаций инвалидов, а также для общественных организаций инвалидов.
Всвязи с этим, налогоплательщики или их обособленные подразделения, которые находятся на присоединенных к городу Москве территориях, могут применять понижательный коэффициент для налога на прибыль, если выполняются условия, которые были установлены законами Московской области, но только за первое полугодие 2012 года. Поскольку с 1 июля 2012 года вышеупомянутые организации потеряли данное право, за второе полугодие 2012 года авансовые платежи по налогу на прибыль и сам налог исчисляется с налоговой базы, которая определяется как разница между налоговой базой за последующие налоговые периоды и налоговой базы за первое полугодие 2012 года.